Die Altarinsel hat der Bildhauer Josef Michael Neustifter aus Eggenfelden gestaltet. Die ganze Ausstattung ist in Bronce ausgeführt. Das Thema der Altarinsel ist Leben in Fülle, Gesundheit und Kraft für unser Christenleben, die ausgeht vom Altar. Der Altar hat in seinem Sepulchrum die Reliquien der hl. Timotheus und der hl. Aurelia, sichtbar an der Frontseite. Die vier Medaillons an den Seiten des Altares zeigen uns die Vision des Propheten Ezechiel von der Tempelquelle, das Wasser das alles gesund macht, wo es hinfließt. Für den Neutestamentlichen ist es das Kreuz von dem aus das lebenspendende Wasser fließt. Das zweite Medaillon zeigt den Propheten Elija. Der Engel fordert ihn auf: "Iß und trink, du hast noch einen weiten Weg vor dir". Das dritte Medaillon zeigt uns das "Mannawunder in der Wüste". Es weist hin auf das eucharistische Brot als Brot vom Himmel. Das vierte Medaillon zeigt uns den knienden Christus, der dem Petrus die Füße wäscht. „Wer unter euch der Größte sein will, muß dem andern dienen". Der Ambo zeigt uns im Medaillon den Propheten Ezechiel, der die Schriftrolle ißt und „sie schmeckte in seinem Mund süß wie Honig". Der Osterleuchter mit der Darstellung des Auszugs des Volkes Israel aus Ägypten unter der Führung des Mose aus der Sklaverei, der Unterdrückung, aus der Arbeit ohne Lohn, aus der Entwürdigung des Menschen in die ersehnte Freiheit weist darauf hin, dass Jachwe „bei Nacht in einer Flamme und bei Tag in einer Wolkensäule" seinem Volk vorangeht. Dass der eigentliche Führer des Volkes Jachwe ist und Mose nur sein Werkzeug. Für den neutestamentlichen Menschen ist der Auferstandene das Licht: "wer mir nachfolgt wandelt nicht im Finstern, sondern hat das Licht des Lebens". Durch das Gespräch der Theologen mit den Künstlern wurde so ein einheitliches Werk geschaffen, das die Waldmünchner froh und stolz macht auf ihre Kirche. St. Stephan ist ein Raum geworden für eine würdige Eucharistiefeier.